4月24日，教育部在其网站上挂出《关于同意建立南方科技大学的通知》，同意建立南方科技大学。这样，从2007年4月开始进入筹建前期工作的深圳南方科技大学，历时4年多，终于获准正式建立。南科大也由此获得“招生证”。
对于南科大获批正式建立，舆论大致有两种不同看法。
一种是，南科大由此被“收编”成为一所体制内的公办学校，因为按照教育部的批文，南科大的所有办学活动，必须按照现行的教育管理制度推进。教育部在批文中明确提到：“南方科技大学应遵守《教育法》和《高等教育法》的基本精神，依法办学，遵循国家基本教育制度”、“学校新专业的增设和专业结构的调整，应按我部有关规定办理”。从文本上解读，南科大拥有的办学自主空间并不比现有的其他公办学校大，包括专业的设置和调整，都需要报批。
另一种是，南科大的改革得到教育部的认可。事实上，早在南科大只获得“准生证”，而没有获得“招生证”时，不少舆论就把这与教育部是否支持南科大的改革联系在一起。而从学校的设立角度看，大学筹建、正式建立，这更多关乎学校的办学基本条件是否达到举办一所大学的要求，而与大学是否推进改革关系不大。就如教育部的批文所称，这是“根据《高等教育法》、《普通高等学校设置暂行条例》和《普通本科学校设置暂行规定》的有关规定”，批准成立的。
当然，大家期待的是，教育部以同意建立的方式，来肯定南科大的改革。这需要看教育部、广东省，以及深圳市政府，接下来采取何种态度对待南科大的具体办学了。
举例来说，教育部批准南科大建设，允许其招生，既可以是完全自主招生，也可以纳入计划内统一招生，是否支持改革，就要看具体允许其采取何种招生模式。如果南科大今年的招生被纳入计划内进行集中录取，那么，可以断定的是，南科大确实被收编了；而如果南科大被允许采取完全自主招生模式，或者由学校自行举行测试、自主录取（类似去年的方式），或者结合统一高考进行自主招生，都表明，南科大改革的希望还在。
或许有人认为，如果南科大今年招收的学生，被要求参加统一高考，就意味着南科大不是进行自主招生。这是不妥当的，南科大是不是自主招生，要看统一高考成绩派什么用场，如果在高考成绩公布后，南科大可自主提出对学生的成绩要求，对申请者结合高考成绩、中学学业成绩、大学面试考察进行综合录取，那么这依旧是自主招生，而且是可以持续的自主招生模式。
另外，以教育部要求“南方科技大学应遵守《教育法》和《高等教育法》的基本精神，依法办学，遵循国家基本教育制度”这一说法，来推论南科大难以改革，也为时尚早。依照当前的教育法律法规，南科大确实难以推进教改，但按照国家《教育规划纲要》的精神，我国的《教育法》和《高等教育法》本就要启动修订，南科大的改革能否获得法律的保障，就要看我国是否按教改精神加快启动修订教育法律法规了。
公众还关心正式获批建立的南科大，能否推进“去官化、去行政化”改革，这则取决于《南方科技大学章程》能否顺利通过深圳市人大常委会的立法。
去年，深圳市已发布《南方科技大学管理暂行办法》，舆论称其为南科大基本法。其实这离基本法还有很远的距离，其中十分重要的一点是，没有提交人大讨论、审议，那不过是行政规章。因此，在执行该暂行管理办法时，校方就难免受到行政的干扰，诸如理事会的组成人员由政府部门委派，而非通过选举产生（理事会的部分成员，比如教师代表、学生代表、社会贤达，应民主选举产生）；政府部门出面公选副校长，而不是由校长提名，提交理事会任命等等，就因缺乏大学章程所致。
需要注意的是，按照我国现行《高等教育法》，注册成为一所高等学校，是需要提交大学章程的，教育部批准南科大设立，显然把目前的“暂行管理办法”作为章程。如果南科大在未来较长时间中不出台真正的章程，其探索现代大学制度的步伐将难以加快。从这一角度看，获批正式建设的南科大，依旧任重道远；就诸多改革问题，在教育部、广东省、深圳市与学校间，还将有博弈。
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